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        在线工具
        为了方便广大科研工作者对各类编码和非编码RNA做结构或序列分析、注释、预测基因靶标、功能查询等生物信息学内容,我们在此汇集了许多常用的在线工具。 RiboBio Galaxy 生信分析平台致力于解决生物信息分析中常见的文本处理、格式转换、以及数据可视化等问题
        EXORBASE

        EXORBASE是由人血液外体的RNA SEQ数据分析衍生的环状RNA(CyCRNA)、长非编码RNA(LNCRNA)和信使RNA(mRNA)的储存库,还包括来自已发表文献的实验验证。EXORBASE基于正常人和不同疾病患者的标准化RNA SEQ数据,整合和可视化RNA表达谱。EXOBASE的目的是收集和表征人类血液外体中的所有长RNA物种。提供了注释、表达水平和可能的原始组织。EXORBASE将帮助研究人员识别血液外体中的分子标记,并将触发新的循环生物标志物发现和人类疾病的功能含义。

        了解更多:http://www.exorbase.org/

        miRBase 21.0

        miRBase序列数据库是一个提供包括 miRNA 序列数据、注释、预测基因靶标等信息的全方位数据库,是 miRNA 研究权威数据依据之一。microRNA 21 0版是最新版本,新版数据库的可靠性进一步提升,总计,新增了4196条发夹前体序列和5441条成熟miRNA,并清除了一些不明确的和错误注释的序列。

        了解更多:http://www.mirbase.org/search.shtml

        NCBI

        NCBI (National Center for Biotechnology Information)是指美国国立生物技术信息中心,NCBI研究小组包括计算机科学家,分子生物学家,数学家,生物化学家,实验物理学家,和结构生物学家,集中于计算分子生物学的基本的和应用的研究。这些问题包括基因的组织,序列的分析,和结构的预测。目前研究计划的一些代表是:检测和分析基因组织,重复序列形式,蛋白domain和结构单元,建立人类基因组的基因图谱,HIV感染的动力学数学模型,数据库搜索中的序列错误影响的分析,开发新的数据库搜索和多重序列对齐算法,建立非冗余序列数据库,序列相似性的统计显著性评估的数学模型和文本检索的矢量模型。另外,NCBI研究者还坚持推动与NIH内部其他研究所及许多科学院和政府的研究实验室的合作。

        了解更多:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/

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